Сайт по продаже строительных материалов просел в выдаче примерно три недели назад, и я долго не понимал почему. Оказалось, куча битых ссылок и страницы без мета-тегов. Что лучше: вручную всё перебирать или сразу запустить автоматическую проверку через сервис?

Я бы не тратил время на ручной разбор это реально долго. У меня ушло недели две на проверку примерно 80 страниц, и всё равно пропустил несколько критичных ошибок. Автоматика в этом плане точнее, хотя не уверен, что она ловит вообще всё подряд.

Только выбором инструмента проблему не решить, если не понимать, что именно влияет на индексацию. Сайт может иметь десятки технических нарушений, которые давят на позиции годами. Нормальный аудит покажет приоритеты: что критично, а что можно отложить. Страницы без мета-тегов, о которых вы говорите это симптом, а не причина. Например, обратите внимание на инструмент для проверки https://pr-cy.ru/audit/